Dvadsať rokov po udalostiach Matrix Revolutions žije Neo zdanlivo obyčajný život ako Thomas A. Anderson v San Franciscu, kde mu jeho terapeut predpisuje modré kapsule. Ani on, ani Trinity sa navzájom nespoznávajú. Morpheus mu však ponúkne červenú kapsulu a znovu otvorí jeho myseľ...
Billie, Pete a ich synovia sú práve na terase, keď ich počas idylickej lyžiarskej dovolenky v Alpách zasiahne lavína. Hoci všetci uniknú bez úhony, Peteove činy počas nešťastia odhalia jeho temnú stránku, ktorá šokuje celú rodinu. Dôsledky tohto okamihu ovplyvnia zvyšok...